Вы можете поменять местоназначение папки, отредактировав файл bootstrap.conf. Измените строку "temp.path=/xxx/xxx", где x - это месторасположение папки, где вы хотите хранить временные файлы.
appdata.path=/Library/Application Support/MailArchiva/ROOT
queue.path=%appdata%/queue
backup.path=%appdata%/backup
temp.path=%appdata%/temp
log.path=/Library/Logs/MailArchiva/ROOT
debuglog.path=%log%/debug
auditlog.path=%log%/audit
keystore.filepath=%conf%/mailarchivacerts
database.file=%appdata%/database/archiva.db
log.level=debug